Zaire ebolavirüsü

Zaire ebolavirüsü
Tek bir filamentli Ebola virüsü partikülünün elektron mikroskobu görüntüsü
Virüs sınıflandırması
Türler:	Zaire ebolavirüsü

Ebola virüsü (EBOV) olarak bilinen Zaire ebolavirüsü, Ebolavirüs cinsi içinde bilinen altı türden biridir. EBOV dahil olmak üzere bilinen altı ebolavirüsün dördü, insanlarda ve Ebola virüsü hastalığı (EVD) olarak bilinen diğer memelilerde şiddetli ve sıklıkla ölümcül bir hemorajik ateşe neden olmaktadır. Ebola virüsü, EVD kaynaklı insan ölümlerinin çoğuna neden olmuştur ve Batı Afrika'daki 2013-2015 Ebola virüsü salgınının nedenidir ve bu da en az 28,646 şüpheli vakada ve 11,323 onaylanmış ölümle sonuçlanmıştır.

Hem Ebola virüsü hem de cinsi ilk başta ilk olarak tanımlandığı ülke olan Zaire (şimdi Kongo Demokratik Cumhuriyeti) olarak adlandırıldı ve ilk başta yakından ilişkili Marburg virüsünün yeni bir "tür" olduğundan şüphelenildi. Virüs, karışıklığı önlemek için 2010 yılında "Ebola virüsü" olarak yeniden adlandırıldı. Ebola virüsü, Mononegavirales düzeni veren Ebolavirus cinsi, Filoviridae familyası cinsinin türü olan Zaire ebolavirus türünün tek üyesidir. Türlerin üyeleri Zaire ebolavirüsleri olarak adlandırılmaktadır. Ebola virüsünün doğal rezervuarının yarasalar, özellikle meyve yarasaları olduğuna inanılır ve temel olarak insanlar arasında ve hayvanlardan insanlara vücut sıvıları yoluyla bulaşır.

EBOV genomu, yaklaşık 19.000 nükleotit uzunluğunda, tek zincirli bir RNA'dır. Yedi yapısal proteini kodlar: nükleoprotein (NP), polimeraz kofaktörü (VP35), (VP40), GP, transkripsiyon aktivatörü (VP30), VP24 ve RNA'ya bağlı RNA polimeraz (L).

Yüksek mortalite oranı (% 83-90'a kadar) nedeniyle EBOV, aynı zamanda ABD Ulusal Sağlık Enstitüleri / Ulusal Enstitü Enstitüleri (Dünya Sağlık Örgütü Risk Grubu 4 Patojen (Biyogüvenlik Seviyesi 4'e eşdeğer tutulma gerektiren) olarak seçmeli bir faktör olarak listelenmiştir. ve Enfeksiyon Hastalıklarının Etkileri A Kategorisi Öncelikli Patojen, ABD CDC Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri A Kategorisi Bir Biyo Terörizm Ajansı ve Avustralya Grubu tarafından İhracat Kontrolü için Biyolojik Bir Madde olarak listelenmiştir.

Yapı

EBOV, virülerde silindirik / tübüler olan ve viral zarf, matris ve nükleokapsid bileşenleri içeren negatif-duyarlı bir RNA genomu taşır. Toplam silindirlerin çapı genel olarak yaklaşık 80 nm'dir ve viral olarak kodlanmış bir glikoproteine (GP) sahip olup, lipid iki tabakalı yüzeyinden 7-10 nm uzunluğunda sivri uçlar şeklinde çıkıntı yapar. Silindirler değişken uzunluktadır, tipik olarak 800 nm'dir, ancak bazen 1000 nm uzunluğa kadardır. Virionun dış viral zarfı, GP sivri uçlarının biyosentezi sırasında sokulduğu konak hücre zarının alanlarından tomurcuklanarak elde edilir. Bireysel GP molekülleri, yaklaşık 10 nm'lik aralıklarla ortaya çıkar. Viral proteinler VP40 ve VP24, zarf ile nükleokapsit (aşağıdakilere bakınız) arasına matris boşluğunda yerleştirilir. Virion yapısının merkezinde, 3′-poliadenilasyon veya 5′-kapaklama olmadan 18-19 kb'lik bir doğrusal, negatif-duyarlı RNA'ya bağlanmış bir dizi viral proteinden oluşan nükleokapsittir; RNA helisel şekilde sarılır ve NP, VP35, VP30 ve L proteinleri ile kompleksleştirilir; bu sarmalın çapı 80 nm'dir.

Saflaştırma ve görselleştirme işleminden sonra viryonların genel şekli (örneğin, sırasıyla ultrasantrifüj ve elektron mikroskobu ile) önemli ölçüde değişmektedir; basit silindirler ters yön gösteren dallardan ve dallardan daha az yaygındır. Bununla birlikte, karakteristik "iplik benzeri" yapı, filovirüslerin daha genel bir morfolojik özelliğidir (GP-süslemeli viral zarf, RNA nükleokapsidinin yanı sıra).

Genome

Her viryon, uzunluğu 18,959 ila 18,961 nükleotid olan bir doğrusal, tek sarmallı, negatif-duyarlı RNA molekülünü içerir.3 ′ terminusu poliadenile edilmez ve 5 ′ ucu kapatılmaz. Bu viral genom, yedi yapısal protein ve bir yapısal olmayan protein kodlar. Gen sırası 3 ′ - lider - NP - VP35 - VP40 - GP / sGP - VP30 - VP24 - L - fragman - 5 ′; lider ve treyler, viral genomların transkripsiyonunu, replikasyonunu ve paketlenmesini yeni viryonlara kontrol etmek için önemli sinyaller taşıyan, transkripsiyonu olmayan bölgelerdir. NP, VP35 ve filovirüslerden L genlerinin bölümleri, birkaç küçük memeli grubunun genomlarında endojen olarak tanımlanmıştır.

3 'ucundan 472 nükleotitin ve 5' ucundan 731 nükleotitin, viral bir "minigenom" un kopyalanması için yeterli olmasına rağmen, enfeksiyon için yeterli olmadığı bulundu. Sierra Leone'de teşhis edilen vakaların %70'inden fazlasını temsil eden Ebola virüs hastalığı olan 78 hastanın virüs dizilimi, 2014 salgınının artık doğal rezervuarı ile yeni temaslar tarafından beslenemediğine dair kanıt sağladı. Üçüncü nesil sıralama teknolojisini kullanarak, araştırmacılar 48 saat kadar kısa bir sürede örnekleri sıralayabildiler. Diğer RNA virüsleri gibi, Ebola virüsü de hastalığın ilerlemesi sırasında bir insanda ve yerel insan popülasyonu arasındaki rezervuarda hızla mutasyona uğrar. Yılda saha başına 2,0 x 10⁻³ sübstitüsyonun gözlenen mutasyon oranı, mevsimsel grip kadar hızlıdır. Bu, virüs insandan insana tekrar tekrar geçerken ve virüs için bir aşının geliştirilmesinde zorluklar doğurabileceğinden, tamamlanmamış saflaştırıcı seçimi temsil etmesi muhtemeldir.

Giriş

Konakçı hücre giriş proteinleri için iki aday vardır. Birincisi, Ebola viryonlarının konakçı hücreye girmesi ve nihai replikasyonu için gerekli görünen, konakçı kodlanmış Niemann-Pick C1 (NPC1) olan bir kolesterol taşıyıcı proteinidir. Bir çalışmada, çıkartılan NPC1 geninin bir kopyası olan fareler, fareye uyarlanmış Ebola virüsüne maruz kalmadan onbeş gün sonra yüzde 80 hayatta kalma oranını gösterirken, değiştirilmemiş farelerin sadece yüzde 10'u bu kadar uzun süre hayatta kaldı. Başka bir çalışmada, viral zarf glikoproteininin (GP) NPC1'e bağlanmasını önleyerek küçük moleküllerin Ebola virüsü enfeksiyonunu inhibe ettiği gösterilmiştir. Dolayısıyla, NPC1'in bu filovirüsün girişi için kritik olduğu gösterilmiştir, çünkü doğrudan viral GP'ye bağlanarak enfeksiyona aracılık eder.

Bu taşıyıcıyı taşımayan Niemann-Pick Tip C bireylerden alınan hücreler, laboratuarda Ebola virüsüne maruz bırakıldıklarında, hücreleri hayatta kaldı ve virüse karşı geçirimsiz gözüktüler; İnsanlarda NPC1 genindeki mutasyonlar, bazı ölümcül virüs hastalığına dirençli kılan bazı bireyleri mümkün kılmak için olası bir mod olarak düşünülmüştür. Aynı çalışmalar, NPC1'in ilgili bir filovirüs olan Marburg virüsü için virüs girişindeki rolüyle ilgili benzer sonuçları tanımladı. Başka bir çalışma da, NPC1'in, viral GP'ye doğrudan bağlanması yoluyla Ebola enfeksiyonuna aracılık eden kritik reseptör olduğuna ve bu bağlanmaya aracılık eden NPCl'in ikinci "lizozomal" alanı olduğuna dair kanıt sunmuştur.

İkinci aday TIM-1'dir (a.k.a. HAVCR1). TIM-1'in, Vero hücrelerinin alım kabiliyetini arttırmak için EBOV glikoproteinin reseptör bağlanma alanına bağlandığı gösterilmiştir. Etkisini siRNA ile susturmak Vero hücrelerinin enfeksiyonunu önledi. TIM1, EBOV lizizinden (trakea, kornea ve konjonktiva) ciddi şekilde etkilendiği bilinen dokularda ifade edilir. TIM-1, ARD5'in IgV alanına karşı bir monoklonal antikor, EBOV bağlanmasını ve enfeksiyonunu bloke etti. Birlikte, bu çalışmalar, NPC1 ve TIM-1'in, bir Ebola anti-viral ilacı için potansiyel terapötik hedefler olabileceğini ve hızlı bir alan tanısı tahlili için bir baz olarak kullanılabileceğini öne sürer.

Replikasyon

Aselüler olduğundan, Ebola gibi virüsler herhangi bir hücre bölünmesi türü yoluyla çoğalmaz; aksine, kendi kopyalarını üretmek için konak hücre yapıları ile birlikte konak ve virüs kodlu enzimlerin bir kombinasyonunu kullanırlar. Bunlar daha sonra, konakçı hücrede viral makromoleküler yapılara birleştirilir. Virüs, her bir hücreyi enfekte ederken bir takım adımları tamamlar. Virüs, glikoprotein (GP) yüzey peplomeri yoluyla konakçı reseptörlerine bağlayarak saldırısına başlar ve konakçı hücrede makropinosomlara endositozlanır. Hücreye nüfuz etmek için viral membran, vezikül membranı ile birleşir ve nükleokapsit, sitoplazmaya salınır. Kapalı, negatif-duyarlı genomik ssRNA, poliadile edilmiş, monosistronik mRNA'ların sentezi (3'-5 ') için bir şablon olarak kullanılır ve konakçı hücrenin ribozomları, tRNA molekülleri, vb. Kullanılarak, mRNA, tek tek viral proteinlere dönüştürülür.

Bu viral proteinler işlenir: bir glikoprotein öncüsü (GP0) GP1'e ve GP2'ye ayrılır; bunlar daha sonra hücresel enzimler ve substratlar kullanılarak yoğun şekilde glikosile edilir. Bu iki molekül, ilk önce heterodimerler ve daha sonra yüzey peplomerleri verecek şekilde trimerler halinde toplanır. Salgılanmış glikoprotein (sGP) öncüsü, her ikisi de hücreden salınan sGP'ye ve delta peptide bölünmüştür. Viral protein seviyeleri yükseldikçe, translasyondan replikasyona bir geçiş meydana gelir. Negatif-sens genomik RNA'yı bir şablon olarak kullanarak, bir tamamlayıcı + ssRNA sentezlenir; bu daha sonra hızlı bir şekilde enkapsüle edilen yeni genomik (-) ssRNA'nın sentezi için bir şablon olarak kullanılır. Yeni oluşturulan nükleokapsitler ve zarf proteinleri, konak hücrenin plazma zarında birleşir; tomurcuklanma hücreyi yok ederek oluşur.

Ekoloji

Ebola virüsü zoonotik bir patojendir. Aracı ev sahiplerinin "Orta ve Sahra altı Afrika'da çeşitli meyve yarasa türleri" olduğu bildirildi. Yarasalardaki enfeksiyonun kanıtı moleküler ve serolojik yollarla tespit edilmiştir. Ancak, ebolavirüsler yarasalarda izole edilmemiştir. Son konaklar, yarasa temasından veya diğer uç konakçılardan enfekte olan insanlar ve mükemmel maymunlardır. Filipinler'deki domuzların Reston virüsü ile enfekte olduğu bildirilmiştir, bu nedenle diğer geçici veya yükseltici konaklar bulunabilir. Ebola virüsü salgınları, sıcaklıklar düşük olduğunda ve nem Afrika için normalden yüksek olduğunda ortaya çıkma eğilimindedir. Bir kişi hastalığın akut fazından kurtulduktan sonra bile, Ebola virüsü gözler ve testisler gibi belirli organlarda aylarca hayatta kalır.

Ebola virüsü hastalığı

Ebola virüsü, insanlarda hastalığa neden olduğu bilinen dört ebolavirüsün biridir. Bu ebolavirüslerin en yüksek vaka-ölüm oranına sahiptir, 1976'da ilk salgınlardan bu yana ortalama yüzde 83'dür, ancak %90'a kadar olan ölüm oranları bir salgında kaydedilmiştir (2002–03). Ayrıca, Ebola virüsünün diğer tüm ebolavirüslerden daha fazla salgınları olmuştur. İlk salgın 26 Ağustos 1976'da Yambükü'de meydana geldi. İlk kaydedilen vaka, 44 yaşında bir öğretmen olan Mabalo Lokela idi. Semptomlar sıtmaya benzerdi ve takip eden hastalara kinin verildi. İletim, sterilize edilmemiş iğnelerin yeniden kullanımı ve kişisel temas, vücut sıvıları ve kişinin temas ettiği yerlerin kapatılması ile ilişkilendirilmiştir. 1976'da Zaire'deki Ebola salgını sırasında Ngoy Mushola, Bumba'dan Yambuku'ya gitti ve burada hastalığın ilk klinik tanımını günlük kayıtlarında kaydetti:

Hastalık, yaklaşık 39° C'lik yüksek bir sıcaklık, hematez, kanlı ishal, retrosternal karın ağrısı, "ağır" eklemlerle prostrasyon ve ortalama üç gün sonra hızlı evrim ölümü ile karakterizedir.

Hastalığın 1976'da Zaire'de kaydedilen ilk klinik tanımından bu yana, Mart 2014'te başlayan son Ebola salgını oranlara ulaştı ve Ocak 2015 itibariyle 8000'den fazla insanı öldürdü. Bu salgın, daha önce hastalıktan etkilenmemiş olan bir bölge olan Batı Afrika'da merkezlenmiştir. Geçiş güzegahı üç ülkede özellikle ağırdı: Gine, Liberya ve Sierra Leone. Batı Afrika dışındaki ülkelerde, en çok etkilenen bölgelerde maruz kalan ve daha sonra hedeflerine ulaştıktan sonra Ebola ateşi semptomları gösteren uluslararası gezginlerle ilgili birkaç vaka bildirildi.

Hastalıkların insandaki şiddeti, hızlı ölümden hafif hastalığa ve hatta asemptomatik cevaba kadar geniş ölçüde değişmektedir. Yirminci yüzyılın sonlarında meydana gelen salgınlarla ilgili çalışmalar, hastalık şiddeti ile virüsün genetik yapısı arasında bir ilişki bulamadı. Bu nedenle, hastalığın ciddiyetindeki değişkenliğin, mağdurlardaki genetik farklılıklarla korele olduğundan şüphelenilmektedir. Bu, hemorajik ateşli virüse insanlara benzer şekilde yanıt veren hayvan modellerinde çalışmak zor olmuştur, çünkü tipik fare modelleri böyle yanıt vermez ve gereken çok sayıda uygun test konusuna kolayca ulaşılamaz. Ekim 2014'ün sonlarında, bir yayın, hemorajik ateşe bağlı ölümcül virüsü içeren bir dizi cevaba sahip olacak şekilde yetiştirilen, genetik olarak farklı bir fare popülasyonu tarafından sunulan, fareye uyarlanmış bir Zaire ebolavirüs türüne verilen yanıtın bir çalışmasını bildirdi.

Aşı

Aralık 2016'da yapılan bir çalışmada VSV-EBOV aşısının, Ebola virüsüne karşı %70-100 etkili olduğu ve bunun hastalığa karşı ilk aşı olduğu bulundu.

Birçok Ebola aşısı adayı 2014'ten önceki on yılda geliştirilmiştir, ancak Ekim 2014 itibariyle, hiçbiri insanlarda kullanılmak üzere Amerika Birleşik Devletleri Gıda ve İlaç İdaresi (FDA) tarafından onaylanmamıştır.

Tarihçe ve adlandırma

Ebola virüsü ilk kez 1976'da Marburg virüsünün olası yeni bir "türü" olarak tanımlandı. Aynı zamanda, üçüncü bir ekip, 1976 salgınının meydana geldiği Ebola Nehri'nden türetilen "Ebola virüsü" adını verdi. Uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi (ICTV), Ebola virüsünü Mononegavirales düzenini veren Ebolavirus, Filoviridae familyasına dahil olan Zaire ebolavirus türü olarak tanımlar. "Ebola virüsü" adı, daha önce 1976 Zaire Ebola virüsü salgınının meydana geldiği Zaire olarak adlandırılan, Demokratik Kongo Cumhuriyeti'ndeki bölgeye yakın olduğu düşünülen bir nehir olan Ebola Nehri'nden gelmektedir.

1998'de virüs adı "Zaire Ebola virüsü" olarak ve 2002'de Zaire ebolavirus türüne dönüştürüldü. Bununla birlikte, çoğu bilimsel makale "Ebola virüsü" nü ifade etmeye devam etti veya Ebola virüsü ve Zaire ebolavirüs terimlerini paralel olarak kullandı. Sonuç olarak, 2010 yılında, bir grup araştırmacı, "Ebola virüsü" adının, EBire kısaltmasıyla birlikte, Zaire ebolavirus türü içerisinde bir alt sınıflandırma için kabul edilmesini önerdi. Virüsün önceki kısaltmaları, EBOV-Z (Ebola virüsü Zaire için) ve ZEBOV (Zaire Ebola virüsü veya Zaire ebolavirüs için) idi.

Zaire ebolavirüs adı, Zaire'den ve taksonomik sonek ebolavirüsünden (bir ebolavirüs türünü belirtir ve Ebola Nehri anlamına gelir) elde edilir. Uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi (ICTV) tarafından kurulan takson adlandırma kurallarına göre, Zaire ebolavirüs adı her zaman büyük harfle yazılır, italikleştirilir ve "türler" kelimesinden önce gelir. Üyelerinin (Zaire ebolavirüsleri) isimleri büyük harfle yazılmalı, italikleştirilmemeli ve makale kullanılmadan kullanılmalıdır. 2011'de, ICTV açıkça bu adı tanıma önerisini reddetti (2010.010bV); Şu anda, ICTV resmi olarak “Ebola virüsü” nü taksonomik olarak tanımıyor ve sadece Zaire ebolavirüs türünü kullanmaya ve tavsiye etmeye devam ediyor. Prototip Ebola virüsü, varyant Mayinga (EBOV / May), 1976 Zaire salgını sırasında ölen bir hemşire olan Mayinga N'Seka olarak seçildi.

Kaynak

Burdaki yer alan bilgiler en:Zaire ebolavirus sayfası'ndan çevirilerek edinilmiştir.